W obecnej strukturze Instytutu nie wydzielono jednostek drugiego rzędu, ale funkcjonuje kilkanaście laboratoriów instrumentalnych, które w poprzedniej strukturze były przypisane do takich jednostek jak katedry i zakłady:
W obecnej strukturze Instytutu nie wydzielono jednostek drugiego rzędu, ale funkcjonuje kilkanaście laboratoriów instrumentalnych, które w poprzedniej strukturze były przypisane do takich jednostek jak katedry i zakłady:
Laboratorium geochemiczne
Laboratorium hydrochemiczne
Laboratorium granulometrii laserowej
Laboratorium sedymentologiczne
Laboratorium preparatyki petrograficznej
Laboratorium mineralogii,
petrografii i geologii złożowej
Laboratorium geologii inżynierskiej i geotechniki
Laboratorium oceanografii fizycznej
Laboratorium mikroskopii geologicznej i biologicznej
Laboratorium biologii morza
Laboratorium paleobiologii
Laboratorium diatomologiczne
Laboratorium badań nad filogenezą i bioproduktami morskich bentosowych protista
Laboratorium genetyczne
Laboratorium dendrochronologiczne
Laboratorium taksonomii roślin i grzybów
Oprócz wymienionych wyżej laboratoriów działalność badawcza Instytutu jest ściśle związana z funkcjonowaniem takich jednostek jak: