Instytut Nauk o Morzu i Środowisku, utworzony decyzją senatu Uniwersytetu Szczecińskiego 01.10.2019 roku, jest kontynuatorem Instytutu Nauk o Morzu, który rozpoczął swoje funkcjonowanie w ramach Wydziału Biologii i Nauk o Morzu Uniwersytetu Szczecińskiego w dniu 1 października 1990 r. Wtedy utworzyły go następujące zakłady naukowe: Teledetekcji i Kartografii Morskiej, Oceanografii Fizycznej, Geomorfologii Morskiej, Klimatologii i Meteorologii Morskiej, Geografii Ekonomicznej Morza, Oceanografii Biologicznej oraz samodzielna Pracownia Dydaktyki Geografii. Dyrektorem Instytutu Nauk o Morzu, od momentu jego powołania do 30.09.2018, był prof. dr hab. Stanisław Musielak (wyłączając kadencję 1996-1999, w której sprawował on funkcję prorektora US).